Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf1B2RRD7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf1B2RRD7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms