Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Rnft1Q9DCN7 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Rnft1Q9DCN7 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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Rnft1Q9DCN7 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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