Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt71Q9R0H5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt71Q9R0H5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms