Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp2c55Q9D816 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms