Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933402E13RikQ9D4D2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms