Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OxsmQ9D404 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OxsmQ9D404 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms