Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spns3Q9D232 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms