Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan11Q9D1D1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms