Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms