Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Knl1Q66JQ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms