Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.2 ms