Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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