Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MitfQ08874 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms