Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme1P97371 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme1P97371 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme1P97371 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms