Protein–RNA interactions for Protein: P53080

EDC1, Enhancer of mRNA-decapping protein 1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EDC1P53080 snR59snR59 78 nt-0.78□□□□□ -2.53
EDC1P53080 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.78□□□□□ -2.53
EDC1P53080 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.78□□□□□ -2.53
EDC1P53080 SNU56YDR240C 1479 nt-0.79□□□□□ -2.54
EDC1P53080 PAA1YDR071C 576 nt-0.79□□□□□ -2.54
EDC1P53080 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
EDC1P53080 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
EDC1P53080 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.79□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.79□□□□□ -2.54
EDC1P53080 GLG1YKR058W 1851 nt-0.8□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.8□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.8□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YOR248WYOR248W 303 nt-0.81□□□□□ -2.54
EDC1P53080 snR33snR33 183 nt-0.81□□□□□ -2.54
EDC1P53080 UBS1YBR165W 834 nt-0.81□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YBR206WYBR206W 324 nt-0.81□□□□□ -2.54
EDC1P53080 snR44snR44 211 nt-0.81□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.82□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YOR366WYOR366W 354 nt-0.82□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YPR096CYPR096C 303 nt-0.83□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.84□□□□□ -2.54
EDC1P53080 ATC1YDR184C 885 nt-0.84□□□□□ -2.54
EDC1P53080 YDR269CYDR269C 324 nt-0.84□□□□□ -2.54
EDC1P53080 BLS1YLR408C 369 nt-0.84□□□□□ -2.54
EDC1P53080 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.85□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YOR364WYOR364W 369 nt-0.85□□□□□ -2.55
EDC1P53080 SVS1YPL163C 783 nt-0.85□□□□□ -2.55
EDC1P53080 SPO21YOL091W 1830 nt-0.85□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.85□□□□□ -2.55
EDC1P53080 LRP1YHR081W 555 nt-0.86□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.86□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YOL106WYOL106W 354 nt-0.86□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YOL160WYOL160W 342 nt-0.86□□□□□ -2.55
EDC1P53080 snR36snR36 182 nt-0.86□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YNL319WYNL319W 441 nt-0.87□□□□□ -2.55
EDC1P53080 ECL1YGR146C 636 nt-0.88□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-0.88□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YML108WYML108W 318 nt-0.88□□□□□ -2.55
EDC1P53080 IRC13YOR235W 315 nt-0.88□□□□□ -2.55
EDC1P53080 POL32YJR043C 1053 nt-0.89□□□□□ -2.55
EDC1P53080 ACF4YJR083C 930 nt-0.89□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YKL111CYKL111C 336 nt-0.89□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.89□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YLR171WYLR171W 390 nt-0.89□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.89□□□□□ -2.55
EDC1P53080 PBI2YNL015W 228 nt-0.89□□□□□ -2.55
EDC1P53080 IRC16YPR038W 360 nt-0.89□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.9□□□□□ -2.55
EDC1P53080 TIM13YGR181W 318 nt-0.9□□□□□ -2.55
EDC1P53080 LIN1YHR156C 1023 nt-0.9□□□□□ -2.55
EDC1P53080 GPX1YKL026C 504 nt-0.9□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YPL261CYPL261C 309 nt-0.9□□□□□ -2.55
EDC1P53080 YGR115CYGR115C 780 nt-0.91□□□□□ -2.56
EDC1P53080 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.91□□□□□ -2.56
EDC1P53080 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.92□□□□□ -2.56
EDC1P53080 CWC23YGL128C 852 nt-0.92□□□□□ -2.56
EDC1P53080 YIR044CYIR044C 186 nt-0.92□□□□□ -2.56
EDC1P53080 YJL120WYJL120W 324 nt-0.92□□□□□ -2.56
EDC1P53080 DCP1YOL149W 696 nt-0.92□□□□□ -2.56
EDC1P53080 IPP1YBR011C 864 nt-0.92□□□□□ -2.56
EDC1P53080 EMC4YGL231C 573 nt-0.93□□□□□ -2.56
EDC1P53080 MRPS8YMR158W 468 nt-0.94□□□□□ -2.56
EDC1P53080 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.95□□□□□ -2.56
EDC1P53080 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.95□□□□□ -2.56
EDC1P53080 snR72snR72 98 nt-0.96□□□□□ -2.56
EDC1P53080 RPS30AYLR287C-A 192 nt-0.96□□□□□ -2.56
EDC1P53080 YGR228WYGR228W 345 nt-0.98□□□□□ -2.57
EDC1P53080 YDR220CYDR220C 294 nt-0.99□□□□□ -2.57
EDC1P53080 PCF11YDR228C 1881 nt-0.99□□□□□ -2.57
EDC1P53080 COG6YNL041C 2520 nt-1□□□□□ -2.57
EDC1P53080 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-1□□□□□ -2.57
EDC1P53080 YBR099CYBR099C 384 nt-1□□□□□ -2.57
EDC1P53080 RRI2YOL117W 1938 nt-1□□□□□ -2.57
EDC1P53080 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-1.01□□□□□ -2.57
EDC1P53080 snR161snR161 161 nt-1.01□□□□□ -2.57
EDC1P53080 GRX5YPL059W 453 nt-1.01□□□□□ -2.57
EDC1P53080 ATG31YDR022C 591 nt-1.02□□□□□ -2.57
EDC1P53080 RPS20YHL015W 366 nt-1.02□□□□□ -2.57
EDC1P53080 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-1.02□□□□□ -2.57
EDC1P53080 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-1.02□□□□□ -2.57
EDC1P53080 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-1.03□□□□□ -2.57
EDC1P53080 SDH7YDR511W 402 nt-1.03□□□□□ -2.57
EDC1P53080 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-1.03□□□□□ -2.57
EDC1P53080 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-1.03□□□□□ -2.57
EDC1P53080 EST1YLR233C 2100 nt-1.03□□□□□ -2.57
EDC1P53080 YGL239CYGL239C 315 nt-1.04□□□□□ -2.58
EDC1P53080 RPS25BYLR333C 327 nt-1.04□□□□□ -2.58
EDC1P53080 YML007C-AYML007C-A 111 nt-1.04□□□□□ -2.58
EDC1P53080 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-1.05□□□□□ -2.58
EDC1P53080 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.05□□□□□ -2.58
EDC1P53080 YHR138CYHR138C 345 nt-1.06□□□□□ -2.58
EDC1P53080 YPR092WYPR092W 306 nt-1.06□□□□□ -2.58
EDC1P53080 YKL202WYKL202W 582 nt-1.07□□□□□ -2.58
EDC1P53080 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-1.08□□□□□ -2.58
EDC1P53080 LOC1YFR001W 615 nt-1.08□□□□□ -2.58
EDC1P53080 VAM3YOR106W 852 nt-1.08□□□□□ -2.58
EDC1P53080 SRB7YDR308C 423 nt-1.1□□□□□ -2.59
EDC1P53080 TAR1YLR154W-C 375 nt-1.1□□□□□ -2.59
EDC1P53080 BER1YLR412W 825 nt-1.1□□□□□ -2.59
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