Protein–RNA interactions for Protein: P36164

TVP38, Golgi apparatus membrane protein TVP38, yeastyeast

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TVP38P36164 IES4YOR189W 351 nt0.54□□□□□ -2.32
TVP38P36164 EFR3YMR212C 2349 nt0.54□□□□□ -2.32
TVP38P36164 LTE1YAL024C 4308 nt0.53□□□□□ -2.32
TVP38P36164 CBS1YDL069C 690 nt0.53□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.53□□□□□ -2.32
TVP38P36164 MMS4YBR098W 2076 nt0.53□□□□□ -2.32
TVP38P36164 YML002WYML002W 2214 nt0.53□□□□□ -2.33
TVP38P36164 BFR2YDR299W 1605 nt0.53□□□□□ -2.33
TVP38P36164 ALG13YGL047W 609 nt0.52□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YLR287CYLR287C 1068 nt0.52□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YOL160WYOL160W 342 nt0.52□□□□□ -2.33
TVP38P36164 RPB10YOR210W 213 nt0.52□□□□□ -2.33
TVP38P36164 snR51snR51 107 nt0.52□□□□□ -2.33
TVP38P36164 WAR1YML076C 2835 nt0.52□□□□□ -2.33
TVP38P36164 RPS27AYKL156W 249 nt0.51□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YLR171WYLR171W 390 nt0.51□□□□□ -2.33
TVP38P36164 RPL26AYLR344W 384 nt0.51□□□□□ -2.33
TVP38P36164 LOA1YPR139C 903 nt0.51□□□□□ -2.33
TVP38P36164 snR41snR41 95 nt0.51□□□□□ -2.33
TVP38P36164 snR54snR54 86 nt0.51□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YAP6YDR259C 1152 nt0.5□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.5□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YKL202WYKL202W 582 nt0.5□□□□□ -2.33
TVP38P36164 IQG1YPL242C 4488 nt0.5□□□□□ -2.33
TVP38P36164 SDH7YDR511W 402 nt0.49□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YLR101CYLR101C 396 nt0.49□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YNL303WYNL303W 348 nt0.49□□□□□ -2.33
TVP38P36164 RAD34YDR314C 2079 nt0.49□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YHL042WYHL042W 453 nt0.48□□□□□ -2.33
TVP38P36164 RPL38YLR325C 237 nt0.48□□□□□ -2.33
TVP38P36164 ATP19YOL077W-A 207 nt0.48□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YBR064WYBR064W 429 nt0.48□□□□□ -2.33
TVP38P36164 snR189snR189 189 nt0.48□□□□□ -2.33
TVP38P36164 DIE2YGR227W 1578 nt0.48□□□□□ -2.33
TVP38P36164 PKH2YOL100W 3246 nt0.47□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.47□□□□□ -2.33
TVP38P36164 YLL007CYLL007C 1998 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 PAN2YGL094C 3348 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 DBP6YNR038W 1890 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YDR344CYDR344C 444 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 GPG1YGL121C 381 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 ECL1YGR146C 636 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 ECM12YHR021W-A 456 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YJR011CYJR011C 786 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 MRPL50YNR022C 420 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YBR206WYBR206W 324 nt0.46□□□□□ -2.34
TVP38P36164 MCM10YIL150C 1716 nt0.45□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.45□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YPL261CYPL261C 309 nt0.45□□□□□ -2.34
TVP38P36164 NIP100YPL174C 2607 nt0.45□□□□□ -2.34
TVP38P36164 ISD11YER048W-A 285 nt0.44□□□□□ -2.34
TVP38P36164 RPS20YHL015W 366 nt0.44□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YKL083WYKL083W 615 nt0.44□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.44□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YPL229WYPL229W 621 nt0.44□□□□□ -2.34
TVP38P36164 INP2YMR163C 2118 nt0.44□□□□□ -2.34
TVP38P36164 PCF11YDR228C 1881 nt0.44□□□□□ -2.34
TVP38P36164 NOP9YJL010C 2001 nt0.43□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.43□□□□□ -2.34
TVP38P36164 MAM33YIL070C 801 nt0.43□□□□□ -2.34
TVP38P36164 YAR047CYAR047C 321 nt0.43□□□□□ -2.34
TVP38P36164 ASE1YOR058C 2658 nt0.42□□□□□ -2.34
TVP38P36164 ATG31YDR022C 591 nt0.42□□□□□ -2.34
TVP38P36164 CHS6YJL099W 2241 nt0.42□□□□□ -2.34
TVP38P36164 PMP1YCR024C-A 123 nt0.41□□□□□ -2.34
TVP38P36164 RPS24BYIL069C 408 nt0.4□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YNL058CYNL058C 951 nt0.4□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.39□□□□□ -2.35
TVP38P36164 OLI1Q0130 231 nt0.38□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YLR434CYLR434C 384 nt0.38□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YOR282WYOR282W 321 nt0.38□□□□□ -2.35
TVP38P36164 NPR2YEL062W 1848 nt0.38□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.37□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YDR426CYDR426C 378 nt0.37□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.37□□□□□ -2.35
TVP38P36164 CUL3YGR003W 2235 nt0.37□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.36□□□□□ -2.35
TVP38P36164 BSC3YLR465C 309 nt0.36□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YLR456WYLR456W 615 nt0.35□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.35□□□□□ -2.35
TVP38P36164 BUL2YML111W 2763 nt0.34□□□□□ -2.35
TVP38P36164 YSP1YHR155W 3687 nt0.34□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YIR044CYIR044C 186 nt0.34□□□□□ -2.36
TVP38P36164 THO2YNL139C 4794 nt0.33□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.33□□□□□ -2.36
TVP38P36164 RPL26BYGR034W 384 nt0.33□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.33□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YPL044CYPL044C 549 nt0.33□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YPL185WYPL185W 396 nt0.33□□□□□ -2.36
TVP38P36164 FYV10YIL097W 1551 nt0.32□□□□□ -2.36
TVP38P36164 CSN9YDR179C 489 nt0.32□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YLR334CYLR334C 381 nt0.32□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YNL211CYNL211C 261 nt0.32□□□□□ -2.36
TVP38P36164 STE5YDR103W 2754 nt0.32□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.31□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.3□□□□□ -2.36
TVP38P36164 PTP2YOR208W 2253 nt0.29□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YPL068CYPL068C 882 nt0.29□□□□□ -2.36
TVP38P36164 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.28□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.6 ms