Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms