Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NclP09405 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NclP09405 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NclP09405 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NclP09405 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NclP09405 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NclP09405 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NclP09405 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NclP09405 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NclP09405 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NclP09405 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NclP09405 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NclP09405 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NclP09405 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NclP09405 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NclP09405 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NclP09405 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NclP09405 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NclP09405 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NclP09405 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NclP09405 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NclP09405 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NclP09405 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NclP09405 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NclP09405 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NclP09405 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NclP09405 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NclP09405 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NclP09405 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NclP09405 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NclP09405 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NclP09405 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NclP09405 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NclP09405 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NclP09405 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NclP09405 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NclP09405 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NclP09405 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NclP09405 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NclP09405 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NclP09405 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NclP09405 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NclP09405 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NclP09405 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NclP09405 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NclP09405 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NclP09405 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms