Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb10O35955 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb10O35955 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms