Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms