Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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Rnft1Q9DCN7 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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Rnft1Q9DCN7 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Rnft1Q9DCN7 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Rnft1Q9DCN7 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Rnft1Q9DCN7 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Rnft1Q9DCN7 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rnft1Q9DCN7 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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