Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms