Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Card11Q8CIS0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.27■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms