Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Foxd1Q61345 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Foxd1Q61345 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Foxd1Q61345 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Foxd1Q61345 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd1Q61345 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Foxd1Q61345 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Foxd1Q61345 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Foxd1Q61345 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Foxd1Q61345 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Foxd1Q61345 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd1Q61345 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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