Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pacs2Q3V3Q7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs2Q3V3Q7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms