Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Prdm6Q3UZD5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Prdm6Q3UZD5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Prdm6Q3UZD5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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