Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MitfQ08874 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MitfQ08874 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms