Protein–RNA interactions for Protein: P70670

Naca, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacaP70670 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NacaP70670 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NacaP70670 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NacaP70670 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NacaP70670 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NacaP70670 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NacaP70670 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NacaP70670 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NacaP70670 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms