Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms