Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms