Protein–RNA interactions for Protein: E9PZZ1

Prdm13, PR domain zinc finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm13E9PZZ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms