Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms