Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms