Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SardhQ99LB7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SardhQ99LB7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms