Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms