Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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