Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

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Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmsQ62270 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmsQ62270 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms