Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Mdc1Q5PSV9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdc1Q5PSV9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms