Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme1P97371 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme1P97371 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms