Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa10P31310 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms