Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cnga1P29974 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms