Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms