Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhoP15409 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhoP15409 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhoP15409 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RhoP15409 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RhoP15409 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhoP15409 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhoP15409 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms