Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde4bB1AWC9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms