Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms