Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms