Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms