Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms