Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms