Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spns3Q9D232 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms